Encephalitozoon cuniculi jest mikrosporą wewnętrzną, powodującą mikrosporydiozę u królików, gryzoni oraz psów i kotów; jest także zoonozą zagrożenia dla ludzi immunokompetentnych i immunosupresyjnych. W Polsce występuje powszechnie w populacjach królików hodowlanych, a także w dzikich gryzoniach, co zwiększa ryzyko zarażenia. Infekcje prowadzą do zapalenia nerek, mózgu i oczu, obniżając wydajność produkcyjną i zwiększając śmiertelność w króliczej hodowli. Straty ekonomiczne w polskim sektorze królików szacuje się na 0,5–1,0 mln PLN rocznie, głównie z powodu obniżonej płodności i konieczności leczenia.